Pada babak kedua, Bayern dikejutkan oleh gol cepat yang dicetak Dortmund pada menit 48 melalui kaki Paco Alcacer. Alcacer mengeksekusi umpan brilian dari Jadon Sancho yang sebelumnya melewati tiga pemain Bayern. Alhasil, Neuer harus memungut bola dari gawangnya untuk pertama kali dalam laga itu.
Bayern pun berusaha untuk bangkit demi menyamakan kedudukan. Robert Lewandowski dan Thomas Muller mendapatkan peluang berturut-turut pada menit 54 serta 56. Akan tetapi, sepakan dari dua pemain Bayern itu belum berbuah hasil.

Terlalu asyik menyerang membuat Bayern lengah sehingga Dortmund mampu menambah gol pada menit 68. Sancho kali mencatatkan gol untuk namanya sendiri setelah menuntaskan operan dari Guerreiro sehingga Bayern pun tertinggal 0-2 dari Dortmund.
Skor 0-2 tentu bukan sesuatu yang diharapkan Bayern pada babak kedua. Lewandowski pun berusaha untuk memimpin penyerangan Bayern agar mampu memperkecil kedudukan. Akan tetapi, Bayern tak bisa membuat perdeaan sehingga The Bavarian –julukan Bayern– kalah 0-2 dari Dortmund dalam laga panas bertajuk Der Klassiker itu.
Berikut susunan pemain Dortmund vs Bayern di Piala Super Jerman 2019:
DORTMUND (4-2-3-1): Marwin Hitz; Lukasz Piszczek, Manuel Akanji, Omer Toprak, Raphael Guerreiro; Axel Witsel, Julian Weigl; Jadon Sancho, Marco Reus, Nico Schulz; Paco Alcacer.
BAYERN (4-3-3): Manuel Neuer; Joshua Kimmich, Niklas Sule, Jerome Boateng, David Alaba; Leon Goretzka, Corentin Tolisso, Thiago Alcantara; Thomas Muller, Kingsley Coman, Robert Lewandowski.
(Fetra Hariandja)