3. Malaysia (36 Kali)
Malaysia dan Timnas Indonesia bertemu 97 kali. Dari total di atas, Timnas Indonesia lebih dominan dengan raihan 39 menang, 22 imbang dan 36 kalah.
Kekalahan terakhir Timnas Indonesia dari Malaysia tercipta di babak kedua Kualifikasi Piala Dunia 2022 zona Asia yang berlangsung di Stadion National Bukit Jalil. Saat itu, skuad asuhan Tan Cheng Hoe menang 2-0 atas Timnas Indonesia.
2. Thailand (37 Kali)
Selanjutnya ada Thailand yang 37 kali mengalahkan Timnas Indonesia. Dari 81 pertemuan, Timnas Indonesia meraup 23 menang, 21 imbang dan 37 kali kalah.
Thailand merupakan momok bagi Timnas Indonesia, khususnya di Piala AFF. Timnas Indonesia empat kali dikalahkan Thailand di final Piala AFF, tepatnya pada 2000, 2002, 2016 dan 2020.
